在因緣際會下由高僧自湄洲祖廟迎請　天上聖母(四媽軟身)金身來宮奉祀，道光二十八年，沈長盛倡捐監修新興宮；咸豐年間士民捐資重修。嗣因年數久遠時有傾頹之慮，宣統辛亥年間由地方仕紳吳貫世、吳盛金倡導重修，捐獻七百八十元作為重修工資。於民國六年重修一次，迨至民國十七年(歲次戊辰年)六月復由地方善信出錢出力重新修建巍峨宮貌，奉祀　天上聖母(四媽會媽祖)。然於民國二十六年日據時代日人推行皇民化運動，不幸將原建於斗六街頭所奉祀　天上聖母之受天宮媽祖廟拆除，同時「新興宮」因設有學堂，夜間為文盲教習語文，經地方仕紳陳情，倖免被拆除，又信徒心誠不避危難，神尊移駕「草嶺」，故四媽金身得以保全未遭焚毀，於風聲鶴唳過後迎四媽回鸞奉祀。

自此「新興宮」成為斗六地區媽祖信仰中心，信徒日增，民國五十年成立第一屆管理委員會，由吳榮洲為主任委員。第二、三屆沈傳利先生，第四屆沈鴻仁先生，第五、六、七、八、九屆王瑞棠先生，民國六十六年鑑于信者日增，且原廟土磚建築廟宇狹窄，重建為鋼筋混凝土廟宇；民國七十三年間竣工。增設三樓正殿供奉玉皇上帝，左奉祀三官大帝，右奉祀神農大帝；二樓左側供奉註生娘娘、觀世音佛祖，右側供奉福德正神以彰顯神恩福祉。第十、十一屆王傳財先生，第十二、十三屆盧元山繼任主任委員。

民國九十四年經由信徒大會同意通過改採擲筊遴選委員監事，民國九十八年八月由擲筊方式選出第十四屆委員、監事，並由賴建文擔任主任委員。

由第十四屆管理委員會向媽祖請示，正名為開基斗六媽，並於民國一○○年完成屋頂北式建築，於民國一○一年並陸續完成三樓凌霄寶殿神龕，重新彩繪，經請示天上聖母後增設供奉南斗星君、北斗星君；二樓增設供奉文昌帝君及文財神;月老星君,供佑十方善信大德完成為斗六文化薪火傳承的信仰中心。並由天上聖母(開基斗六媽)擇於壬辰年(民國一○一年)十月份完成安龍謝土拜斗儀式,於甲午年十月(民國一0三年)完成三載圓醮儀式。

新興宮所奉祀　天上聖母(開基斗六媽)，從清嘉慶元年至今，護佑地方黎民，風調雨順，已有二百多年，十方善信絡繹前來參拜，香火鼎盛，虔祈香煙傳萬代、庇佑眾生合境永平安。