本宮最初奉祀主神，為殷府三千歲，後增奉謝府元帥及太子，三尊合奉為一宮，因無歷史淵源記載，悉依神指言及前人歷代所傳之口述據稱約西元1496年前有本庄於車仔人士，從廣東迎奉一尊殷府三千歲來台，經基隆、苗栗、嘉義等地最後落腳本庄，經歷數十年之後，某年八月十六日，在其自宅安座，因其威零顯赫，同庄居民莫不爭欲迎其家中恭奉，庄民乃共同倡議，於神誕之日，在神前焚香卜杯，以杯數多者迎其家中恭奉，翌年聖誕家辰，舉行大點全庄信徒備牲筵為神祝壽，此後數十年，悉依此例進行，做輪流之恭奉，此乃初期恭奉陰府三千歲之方式也。其後，因林老先生作古，由其子林棟先生秉承父志，乃依前例舉行神誕祭典事宜，因鑑於無廟宇之建立，神明不得安其所，乃斥資築建一座小廟，安座之日，大演梨園，以示慶祝，當時林棟先生即見其父真魂顯化，足見冥冥之中，對神之虔敬，必然深感從茲神明有所托寄而償心願，由是傳聞全庄信眾，為之振奮，益感尊神之顯赫，香煙亦日益而鼎盛，也即林棟先生之功也。 又經數十年，有一陳宇先生從福建迎來一尊謝府元帥，初奉於台南安平之自宅，當時元帥指點，威力無從發揮，有意他遷，因陳宇先生之虔奉而未果，後因別世，由其子陳杏先生接奉，然因為官無暇顧及，乃由當時有位陳少先生，將元帥迎至魚塭寮，由是乏人恭奉，事為一為陳士先生獲悉，將元帥迎來本宮，此為本宮謝府元帥之由來。