飛鳳寺基主神，原觀音佛祖，其寶像由來係在本庄黃順興先生家中迎請本寺供祀，經幾年後為了信徒建議再粧佛祖金身乙尊，自原佛祖還黃順興先生，本寺再粧的佛祖也就是南海觀音佛祖，配祀朱府千歲；吳萬居先生在枋寮討海，遇病夢王爺救難，感恩再生之德，迎回本寺奉祀，此為朱府千歲供祀由來。後來廣澤尊王大陸帆船遭遇颱風，漂流來本庄靠淺海灘，目堵本庄，夜托夢本境信徒洪萬法、洪教兩昆仲，洪氏等冒暴風雨依據指點地置，果應夢事，即刻拾裡紅綢請回本寺膜拜，因尊王之威靈赫濯，相輔佛祖神威特殊，主神南海觀音佛祖慈悲心感動，特即禪讓主神位予廣澤尊王經過數百年歷史。
南安詩山鳳山寺保安廣澤尊王，乙丑年遊台巡香，西元2009年7月23日，駐蹕飛鳳寺，諸信眾爭相禮敬膜拜，使本寺蓬畢生輝。

自古以來，喜鵲代表吉祥喜慶，在傳統文化中，喜鵲是非常受歡迎的一種鳥類，是好運與福氣的象徵，本寺在安座入廟前夕，廟頂龍頭上有對喜鵲築巢，為廟宇界首見。因基主神供奉的廣澤尊王鳥有段傳說，信徒認為是“神跡”及“龍來好運”，爭相走報。
此外，在中國的民間傳說中，每年的七夕人間所有的喜鵲會飛上天河，搭起一條鵲橋，引分離的牛郎和織女相會，因而在傳統文化中鵲橋常常成為男女情緣。

本寺歷經第五次動工重建，耗資二億多興建完成；整體寺觀碧瓦朱甍、巍峨壯觀、金碧輝煌。新建大殿龍柱、青石圓柱雄偉壯觀、木石雕刻精細、兩側細緻交趾陶堵人物栩栩如生，門口石獅祈求吉慶，兩側依次建有右邊龍鐘樓，左邊鳳鼓樓，石雕氣勢輝宏。
仿唐廟外牆
進入本寺前首先映入眼簾的外牆，整體牆面仿唐廟古典式建築風格設計，牆面的高低起伏宛如一條神龍圍繞四周護衛廟殿，外牆柱塔燈為仿唐代相思燈設計而成，照明八方光輝，十分壯觀。

雙獅戲珠
寺廟前置放高四米寬二米的左雄獅，右雌獅，石雕氣勢輝宏搖頭擺尾，鼻子特別大，俗稱「好鼻獅」，鬃毛卷曲，線條優美。

栩栩如生石雕
登上飛鳳寺階梯，位廟宇中軸線上台基與兩側階梯間的坡道，呈入眼前的是華麗的九龍壁稱之為御路、龍陞或螭陛；兩側階梯旁雕刻彌勒佛神像與八仙過海，在廟殿後方的九龍壁雕刻栩栩如生，更展現了傳統工藝之美。

大殿金碧輝煌
步入大殿內呈現眼前的木石雕刻手工精細，猶如鬼斧神工震攝人心；大殿天井採活動式設計，四面金碧輝煌係由金箔一片一片鑲貼而成，殿內吊燈富麗堂皇照明眾生平安萬事如意。

大孝成神聖王公
在寺廟二樓後面有一幅石窗，敘述者廣澤尊王大孝成神的感人故事。

3D彩繪虎
是由一位劉燕祈師父，以細膩的手法將一對散步的老虎母子，以3D細緻的表現手法畫得栩栩如生，不論遠看近觀都會隨著您360度的移動喔!歡有空來參拜時一定要來看看喔。

跤趾陶
由行政院文建會認可之國寶級師傅—林光沂老師親塑，；左側是陶塑—上馬金下馬銀、右側是陶塑—退寇盜佑黎民，每一個陶塑人物細膩逼真，把三國時代一些歷史故事及八仙人物、服飾、背景、用色等跤趾陶藝術表現得淋漓盡致。