草屯朝清宮媽祖廟所奉祀天上聖母，並非先民自大陸恭迎來台或是祖廟分靈而來，係於民國54年住草屯鎮之仕紳 林清南 先生，因其媳婦為病魔纏身，到處求醫均藥石罔效，家人焦急萬分，遂前往清水鎮菁埔里吳送先生府上恭迎聖母金尊回家中駐駕醫治媳疾，因聖母神威顯赫，不數日媳疾痊癒。病癒後聖母將回駕清水，林家老少為感聖母再造之恩，堅欲挽留聖母再駐之意，聖母感念林家同姓子弟虔誠奉敬，即降駕指示，若不嫌棄，三樓可鎮座一尊護家神明，於是 林清南 先生即依聖示雕刻聖母金身乙尊，並擇日安座，於安座之時聖母降示，本神乃鹿港天后宮 湄州天上聖母分靈。